Una proteína ancestral modificada, como nueva herramienta para estudiar la biología del ARN

Publicado originalmente por el Instituto de Ciencia y Tecnología de Okinawa el 2 de diciembre de 2024

Actividad de metilación de variantes de M.EcoGII en células HEK293T. Crédito: Nucleic Acids Research (2024). DOI: 10.1093/nar/gkae887

Al deducir las posibles formas antiguas de una enzima bacteriana, los científicos del OIST han resucitado una de sus versiones ancestrales, con una capacidad comparativamente mayor para modificar químicamente el ARN.

En la última publicación de la Unidad de Ingeniería y Evolución de Proteínas en Nucleic Acids Research, el equipo presenta una ARN metiltransferasa modificada por ingeniería, que puede utilizarse para estudiar el papel de las modificaciones del ARN en las células.

Las modificaciones del ARN afectan a su estabilidad, favorecen su traducción e influyen en su localización dentro de la célula, por lo que desempeñan un papel importante en la salud celular y en las enfermedades.

Yoshiki Ochiai, primer autor del artículo y estudiante de doctorado en la Unidad de Ingeniería y Evolución de Proteínas, intentó mejorar la actividad de metilación del ARN de una metiltransferasa de ADN bacteriana no específica de sitio M.EcoGII con una actividad residual para la metilación del ARN. A continuación, el equipo investigó su historia mediante análisis bioinformáticos para comprender si sus antepasados eran ARN o ADN metiltransferasas.

Tras inferir las secuencias de los antepasados de la proteína, el equipo analizó proteínas que podrían haber tenido una mayor actividad de ARN metiltransferasa. Entre estas candidatas, el equipo encontró una variante que modificaba preferentemente el ARN y la denominó SUPer ARN EcoGII Metiltransferasa (SUPREM).

La selectividad de esta enzima por el ARN, su elevada actividad de metilación y el hecho de que pudiera ser activa en células de mamíferos sugieren que SUPREM podría utilizarse para desarrollar nuevas herramientas para investigar las modificaciones del ARN en diversas enfermedades.

Más información: Yoshiki Ochiai et al, SUPREM: an engineered non-site-specific m6A RNA methyltransferase with highly improved efficiency, Nucleic Acids Research (2024). DOI: 10.1093/nar/gkae887

Información de la revista: Nucleic Acids Research

Proporcionado por Okinawa Institute of Science and Technology

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